Основан в 1930 г. За время существования факультета подготовлено около 7000 врачей-гигиенистов. Первым деканом санитарно-гигиенического факультета был назначен Б.Н. Страдомский.
На факультете функционировали крупные учебно-научно-исследовательские комплексы, исследовано более 500 вредных веществ и полимерных материалов в окружающей среде. Разработана методология гигиенических исследований оценки полимерных материалов в среде обитания человека, в том числе и на пилотируемых космических объектах; осуществлена микробная биотрансфомация нутрицевтиков и коррекция микроэлементного питания. Проводились фундаментальные исследования и эпидемиологии туберкулеза, дифтерии, в установлении ареалов природно-очаговых микробных и вирусных заболеваний (малярия, туляремия, крымская геморрагическая лихорадка), по профилактике внутрибольничных инфекционных заболеваний. Создана и апробирована бесклеточная коклюшная вакцина, внедрен в практику метод иммунодиагностики некоторых опухолей человека.