Обучение по программам высшего образования — программам ординатуры реализуется на 64 кафедрах по 62 специальностям:
31.08.01 Акушерство и гинекология
31.08.02 Анестезиология-реаниматология
31.08.05 Клиническая лабораторная диагностика
31.08.07 Патологическая анатомия
31.08.08 Радиология
31.08.09 Рентгенология
31.08.10 Судебно-медицинская экспертиза
31.08.11 Ультразвуковая диагностика
31.08.12 Функциональная диагностика
31.08.14 Детская онкология
31.08.15 Детская урология-андрология
31.08.16 Детская хирургия
31.08.17 Детская эндокринология
31.08.18 Неонатология
31.08.19 Педиатрия
31.08.20 Психиатрия
31.08.21 Психиатрия-наркология
31.08.24 Судебно-психиатрическая экспертиза
31.08.26 Аллергология и иммунология
31.08.28 Гастроэнтерология
31.08.29 Гематология
31.08.30 Генетика
31.08.32 Дерматовенерология
31.08.35 Инфекционные болезни
31.08.36 Кардиология
31.08.37 Клиническая фармакология
31.08.39 Лечебная физкультура и спортивная медицина
31.08.42 Неврология
31.08.43 Нефрология
31.08.44 Профпатология
31.08.45 Пульмонология
31.08.48 Скорая медицинская помощь
31.08.49 Терапия
31.08.51 Фтизиатрия
31.08.53 Эндокринология
31.08.54 Общая врачебная практика (семейная медицина)
31.08.55 Колопроктология
31.08.56 Нейрохирургия
31.08.57 Онкология
31.08.58 Оториноларингология
31.08.59 Офтальмология
31.08.60 Пластическая хирургия
31.08.62 Рентгенэндоваскулярные диагностика и лечение
31.08.63 Сердечно-сосудистая хирургия
31.08.65 Торакальная хирургия
31.08.66 Травматология и ортопедия
31.08.67 Хирургия
31.08.68 Урология
31.08.69 Челюстно-лицевая хирургия
31.08.70 Эндоскопия
31.08.71 Организация здравоохранения и общественное здоровье
31.08.72 Стоматология общей практики
31.08.73 Стоматология терапевтическая
31.08.74 Стоматология хирургическая
31.08.75 Стоматология ортопедическая
31.08.76 Стоматология детская
31.08.77 Ортодонтия
32.08.07 Общая гигиена
32.08.11 Социальная гигиена и организация госсанэпидслужбы
32.08.12 Эпидемиология
32.08.14 Бактериология
33.08.02 Управление и экономика фармации